Thanh toán qua ngân hàng HĐ GTGT > 20tr

Chào mọi người.
Các bạn cho mình hỏi với nhe. Cty minh mua hàng hoá dịch vụ của cty A 30 000 000 VND. Theo luật mới phải thanh toán qua ngân hàng mà kế toán bên minh thanh toán trực tiếp. Bây giờ mọi người cho mình hỏi la HĐ GTGT 30tr do minh kê khai thuế như nào là chính xác:
+ Kê khai trực tiếp ko tình VAT
+ Vẫn kê khai khấu trừ VAT bình thường.
Nếu mình kê khai trực tiếp ko được khấu trừ thuế VAT thì có bị phạt ko? và mức phạt là bao nhiêu.
Cảm ơn các bạn