thuế gtgt phải nộp

Các Bác ơi chỉ giùm Em với: Tháng 12 năm 2008 cty Em phải nộp thuế GTGT là 91.112.447 do 1 số hoá đơn đầu vào tháng 1 /2009 bọn Em mới lấy được trong khi hoá đơn đầu ra thì phải xuất rồi.Nhưng tháng 12/2008 cty Em chưa nộp thuế GTGT đó.Vậy khi đến tháng 1/2009 này Em phải kê khai trên tờ khai thuế như thế nào tại chỉ tiêu 11 ( số thuế GTGT được khấu trừ kỳ trước ), Em cứ ghi âm số tiền đó và kê khai bình thường hay là ghi số 0 ( tức là số tiền thuế đó coi như đã nộp rồi nhưng là nợ ) như thế cơ quan thuế có chấp nhận không ? Em ở HN chi cục thuế Cầu Giấy.Mong các Bác chỉ giup Em sớm.Em Cảm ơn rất nhiều.