Hóa đơn trên 20.000.000, thanh toán bằng giấy nộp tiền mặt có được khấu trừ không?

Chào cả nhà cả nhà cho e hỏi. Ngày 20/06/2011 e có mua hàng hóa với giá 60.000.000(VAT 10%, hạn TT là 10 ngày). nhưng ngày 01/06/2011 bên e đã nộp tạm ứng bằng giấy nộp tiền 20.000.000. đến ngày 21/06/2011 bên e đã chuyển khoản trả 30.000.000 và đến nay thì chưa thanh toán hết. Vậy HĐ trên có được khấu trừ không? nếu không thì e phải làm KKBS giảm số thuế GTGT được khấu trừ là 3.000.000 hay 1.000.000. Cả nhà ai biết chỉ e với.Khi điều chỉnh trên tờ điều chỉnh mình chỉ ghi giảm phần thuế GTGT thôi còn phần giá trị hàng hóa vẫn giữ nguyên phải không?