Kê khai thiếu đầu vào của tờ khai thuế GTGT.

Mong mọi người chỉ giúp! Tôi mới về làm kế toán cho công ty và khi xem kê khai và các HĐ chứng từ tôi thấy kế toán cũ làm sai nhưng tôi không biết xử lý thế nào.
Tôi thấy kê khai tháng 2 bị thiếu VAT được khấu trừ: Nghĩa là ở bảng kê thì kế toán có kê đầy đủ HĐ đầu vào nhưng khi ra tờ khai thì VAT ở chỉ tiêu 23 (Thuế VAT được khấu trừ trong kỳ).(tổng thuế VAT mua vào) thiếu so với ở chỉ tiêu 22 (tổng thuế VAT mua vào). (không có bảng điều chỉnh giảm).
Tháng 3 cũng kê đầy đủ HĐ đầu vào nhưng ở phần HĐ HHDV mua vào không chịu thuế lại cộng thiếu giá trị HHDV mua vào. Kê 3 HĐ nhưng cộng lại thì chỉ có giá trị của 2 HĐ thôi. Lại còn làm mất 1 HĐ GTGT mua vào nữa.
Mọi người chỉ giúp bây giờ tôi phải làm thế nào với HĐ bị mất, VAT thiếu và giá trị HHDv mua vào bị thiếu đó? Xin chân thành cảm ơn!