Như vậy thì xuất hóa đơn đầu ra được ko?

Xin chào các bác, Công ty E mới thành lập hồi tháng 11/07. E xin hỏi các bác một vấn đề như thế này ạ:
- thứ 1: E có một cửa hàng ăn nhanh nhưng ko đăng ký kinh doanh, do nhiều khách muốn lấy hóa đơn quá nên E sáp nhập cửa hàng này vào Công ty TNHH của E được ko ạ? thủ tục sáp nhập là như thế nào ạ? sau khi sáp nhập xong E có thể xuất hóa đơn đầu ra cho khách hàng được ko ạ? đầu vào thì toàn rau quả thịt thà ở chợ, làm gì có hóa đơn đâu mà khấu trừ?
- thứ 2: E có một cái xe ô tô, như vậy thì có phải đăng ký với bên Cục thuế để xuất hóa đơn được ko ạ? E cho thuê ô tô và kinh doanh vận tải thì xuất hóa đơn đầu ra như thế có gì là phạm pháp ko nhỉ? Rất mong được sự quan tâm trả lời giúp đỡ của các bác.